Teoricamente lo que tu vayas pagando de alquiler se resta en el momento de la compra.
Si lo venden por 200.000€ y en tres años de alquiler por ejemplo has pagado 6.000€ pues la venta se efectuara por 184.000€.
Eso si, mirate muy bien las condiciones, porque hay algunos que te ponen alquiler con opcion a compra de 5 años por ejemplo, a los 5 años o compras el piso o si el propietario quiere no tiene obligacion ninguna de renovarte el alquiler.
Si tienes claro que en X años, lo compras o te vas... esta bien. Sobretodo si lo compras porque ya tendras un poquito pagado...